Το όνομα “Boerboel” προέρχεται από τις λέξεις “boer” που σημαίνει “αγρότης” και “boer” που σημαίνει “σκύλος” της γλώσσας Αφρικάανς (ή αφρικανολλανδικά – είναι δυτική γερμανική γλώσσα, με προέλευση τα ολλανδικά). Η φυλή δημιουργήθηκε από τους Ολλανδούς αποίκους (17ος αιώνας) στην περιοχή της Νότιας Αφρικής και ως “σκύλος των αγροτών” αναπτύχθηκε και χρησιμοποιήθηκε αποκλειστικά για την προστασία των αγροκτημάτων τους. Η επιλεκτική εκτροφή τους είχε ως αποτέλεσμα την ανάπτυξη ιδιαίτερων χαρακτηριστικών που επέτρεπαν σε αυτά τα σκυλιά να υπερασπιστούν την οικογένεια, το αγρόκτημα και το κοπάδι τους από αρπακτικά της Αφρικής όπως ύαινες, λιοντάρια, τσιτάχ (γατόπαρδους), ακόμα και μπαμπουίνους.

Οι πρώτοι άποικοι έφεραν μαζί τους μεγάλους σκύλους τύπου Μαστίφ τους οποίους σταδιακά διασταύρωσαν με οικόσιτους σκύλους της περιοχής και διάφορες ευρωπαϊκές φυλές. Μπουλντόγκ (Bulldog) και Μαστίφ (Mastiff) που έφτασαν από την Αγγλία και Μπουλμαστίφ (Bullmastiff) που χρησιμοποιούνταν στην φύλαξη των ορυχείων διαμαντιού De Beers, συνέβαλαν στη δημιουργία της φυλής όπως είναι σήμερα. Είναι αβέβαιο ακριβώς από ποιες φυλές έχει προγονικές ρίζες το Νοτιοαφρικανικό Μαστίφ, αλλά μόνο τα ισχυρότερα σκυλιά που μπορούσαν να επιβιώσουν στο καυτό κλίμα και τις συμπλοκές με τα άγρια θηρία της Αφρικής, συνέβαλαν στην αντοχή και τη δύναμη της φυλής.

Τον 19ο αιώνα, καθώς οι Βρετανοί άρχισαν να αποικίζουν διάφορα μέρη του κόσμου, η επιρροή τους άρχισε να ενοχλεί τους περισσότερους από τους αρχικούς αποίκους και τους γηγενείς πληθυσμούς και έτσι άρχισαν να μεταναστεύουν προς την αφρικανική ενδοχώρα. Τα Νοτιοαφρικανικά Μαστίφ τους ακολούθησαν σε απομακρυσμένα χωριά και κοινότητες όπου και απέκτησαν ουσιαστικό ρόλο στην κοινωνία. Χρησιμοποιήθηκαν εκτενώς για κυνήγι, φύλαξη και βοσκή κοπαδιών και προστασία από κλέφτες.

Με την πάροδο του χρόνου και ειδικά μετά τους Παγκόσμιους Πολέμους, η μεγάλη ανάπτυξη της Νότιας Αφρικής είχε ως αποτέλεσμα η χρησιμότητα των σκύλων αυτών ολοένα και να λιγοστεύει. Οι διασταυρώσεις με άλλες φυλές ήταν πολύ συνηθισμένες, χωρίς να λαμβάνεται υπόψη η καθαρότητα της φυλής, και ο πληθυσμός της φυλής μειώθηκε δραματικά φτάνοντας στα όρια του αφανισμού. Στη δεκαετία του 1980, ωστόσο, μια ομάδα εκτροφέων προσπάθησε με συστηματικές και επιλεκτικές αναπαραγωγές να σώσει τη φυλή. Λόγω των προσπαθειών τους, το Νοτιοαφρικανικό Μαστίφ κέρδισε δημοτικότητα στη Νότια Αφρική και άρχισε να εξάγεται σε όλο τον κόσμο.

Το Νοτιοαφρικανικά Μαστίφ αναγνωρίστηκε επίσημα από το American Kennel Club το 2015 και κατατάχτηκε στην κατηγορία Σκύλων Εργασίας. Ωστόσο, η φυλή, εξακολουθεί να είναι αρκετά σπάνια εκτός της Νότιας Αφρικής.